metabase 开源协议_massflow软件

(3) 2024-09-19 10:23

Hi,大家好,我是编程小6,很荣幸遇见你,我把这些年在开发过程中遇到的问题或想法写出来,今天说一说
metabase 开源协议_massflow软件,希望能够帮助你!!!。

全文共6522字,预计学习时长19分钟

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图源:Unsplash

前不久,AWS re:Invent, Netflix 开源了一个自主开发的构建和管理数据科学项目的框架——Metaflow。在过去的两年里,他们内部数据科学团队迅速地应用它,使得许多项目能够缩短生产时间。

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Netflix采用Metaflow

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什么是Metaflow?

Metaflow是创建和执行数据科学工作流的框架,并配备了内置功能:

· 管理计算机资源,

· 执行容器化运行,

· 管理外部依赖,

· 版本、重播和恢复工作流运行

· 客户端 API 检查过去的运行适合笔记本电脑,

· 在本地,比如笔记本电脑,和远程云端执行模式之间切换

在内容寻址的数据存储中,Metaflow 自动对代码、数据和依赖关系进行快照,这通常由 S3支持,但也支持本地文件系统。这样就可以总结工作流,重现过去的结果,并检查关于工作流的任何东西,例如笔记本。—— Ycombinator上的vtuulos

基本上它旨在提高数据科学家的生产力,使他们能够专注于实际的数据科学工作,促进其交付成果的更快生产。

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实际数据科学与基础设施需要

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每天都有可能发生的事情

· 协作:帮助另一个数据科学家调试错误。希望可以在自己的笔记本电脑中按原样调出他失败的运行状态。

· 恢复运行: 运行失败或故意停止。修复代码中的错误后,希望可以从工作流失败、或停止的地方重新启动工作流。

· 混合运行:希望在本地运行工作流中的一个步骤,可能是数据加载步骤,因为数据集下载文件夹中;但是希望在云上运行另一个计算密集步骤:模型训练。

· 检查运行元数据: 三位数据科学家一直在调整超参数,以便在同一模型上获得更高的准确性。需要分析他们所有的训练运行情况,并选择性能最好的超参数集。

· 相同软件包的多个版本: 希望能够在项目中使用sklearn库的多个版本:0.20版本用于预处理步骤,0.22版本用于建模。

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典型的Meta(工作)流是什么样子的?

概念

Metaflow工作流本质上是DAGs (有向无环图) 。下面的图像对其进行了最好的描述。图中的每个节点代表工作流中的一个处理步骤。

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线性无环图

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支化无环图

Metaflow在工作流程的每个步骤中执行惯用的 python 代码,在独立容器中与其相应的依赖项打包。

Metaflow架构的这个关键方面能够从 Metaflowsconda 生态系统中注入几乎所有的外部库,无需插件。这也是Metaflow 与其他通用解决方案(如Airflow)的不同之处。

程序

只要满足以下最低条件,每个流都可以写成标准的 python 类:

· 继承来自Metaflow的FlowSpec类。

· 每个表示步骤的函数都被@step标记。

· 每个步骤函数应以指向其后续步骤函数结束。可以使用self.next(self.function_name_here)完成此操作

· 实现start和end功能。

下面是最小三节点流three-node flow的示例:

start → process_message → end

  1. from metaflow import FlowSpec, step
  2. classLinearFlow(FlowSpec):
  3. """
  4. A flow to verify you can run a basic metaflow flow.
  5. """
  6. # Global initializations here
  7. @step
  8. defstart(self):
  9. self.message ='Thanks for reading.'
  10. self.next(self.process_message)
  11. @step
  12. defprocess_message(self):
  13. print('the message is: %s'%self.message)
  14. self.next(self.end)
  15. @step
  16. defend(self):
  17. print('the message is still: %s'%self.message)
  18. if__name__=='__main__':
  19. LinearFlow()

metaflow-linear-example.py hosted with ❤ by GitHub

最小三节点流: start→ a → end

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安装指示

安装和基本运行

· 安装Metaflow(推荐Python3): pip3 install metaflow

· 将上面的Snippet 1 中的示例代码放在linear_flow.py文件中。

· 看这个流程的设计: python3 linear_flow.py show

· 运行流程: python3 linear_flow.py run

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样流运行

这里有一些值得注意的事情。Metaflow 创建一个本地数据存储.metaflow,它存储与运行关联的所有运行元数据和数据快照。如果配置了云设置,数据快照将存在于 AWS S3Bucket 中,并且运行元数据将加载到由 RDS (关系数据存储)提供的元数据服务中。后文将看到如何使用客户端 API 轻松地检查这个运行元数据。另一个值得注意的微妙但重要的事情是,每个步骤附加的 pid(process ID)是不同的。回到先前的观点,Metaflow将流的每个步骤分装,并在它们自己的环境中运行它们(只是来回传输数据)

Conda设置(如果计划注入依赖项)

· 下载并安装 Miniconda

· 添加 conda频道: conda config --add channelsconda-forge

· 现在可以在工作流中注入conda依赖项了。后文将展示细节。

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实施更现实的工作流

在阅读中会介绍及解释 Metaflow 的新概念。

任务

在这个流程中,将实现一个工作流

1. 将CSV插入到Pandas数据框架中

2. 并行计算各种类型的四分位统计数据

3. 保存特定类型统计数据的字典。

流程

下面的框架能帮你更好理解一般流程。

  1. from metaflow import FlowSpec, step, catch, retry, IncludeFile, Parameter
  2. classGenreStatsFlow(FlowSpec):
  3. """
  4. A flow to generate some statistics about the movie genres.
  5. The flow performs the following steps:
  6. 1) Ingests a CSV into a Pandas Dataframe.
  7. 2) Compute quartiles for each genre in parallel
  8. 3) Save a dictionary of genre specific statistics.
  9. """
  10. @step
  11. defstart(self):
  12. """
  13. The start step:
  14. 1) Loads the movie metadata into pandas dataframe.
  15. 2) Finds all the unique genres.
  16. 3) Launches parallel statistics computation for each genre.
  17. """
  18. # TODO: Loading the CSV and getting unique genres
  19. self.genres = []
  20. self.next(self.compute_statistics, foreach='genres')
  21. @catch(var='compute_failed')
  22. @retry(times=1)
  23. @step
  24. defcompute_statistics(self):
  25. """Compute statistics for a single genre. Run in cloud"""
  26. self.genre =self.input
  27. # TODO: Computing statistics for a genre
  28. self.next(self.join)
  29. @step
  30. defjoin(self, inputs):
  31. """Join our parallel branches and merge results into a dictionary."""
  32. # TODO: Joining the results
  33. self.next(self.end)
  34. @step
  35. defend(self):
  36. """End the flow."""
  37. pass
  38. if__name__=='__main__':
  39. GenreStatsFlow()

metaflow_genre_stats_workflow_skeleton.py hosted with ❤ by GitHub

上面的框架中引入了一些概念

· 注意到start步骤第24行的foreach参数了吗? foreach在 for 循环中为类型列表中的每个条目执行compute_statistics 步骤的并行副本。

· 在26行,@catch(var='compute_failed') 会捕获compute_statistics步骤中发生的任何异常,将其标记为compute_failed 变量,可供后继查看。

· 在27行,@retry(times=1) 做它所暗示的事情,重试步骤,以防出现任何错误。

· 在compute_statistics31行, self.input 是怎么魔幻登场的? input 是Metaflow提出的类变量,包含适用compute_statistics的示例数据。比如当有多个副本的函数并行运行时该怎么做?只有当一个节点分支到多个并行进程时,或者当多个节点合并为一个时,Metaflow才会添加它。

· 这个示例任务只展示相同compute_statistics功能的多个并行运行。但是那些好奇的人可能同时启动完全不同、且毫不相关的功能。要想这么做,把24行换成self.next(self.func1, self.function2,self.function3). 当然也必须相应地更新 join 步骤。

这是框架型的视觉图表

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Visual Flow视觉流

读取数据文件和自定义参数

· 下载此 csv 文件,其中包含Metaflow 准备的电影数据。

· 现在我们希望支持动态传入 movie_data 文件路径和max_genres 值作为外部参数到我们的工作流中。Metaflow 允许通过运行命令中附加额外的标志来传递 args。例如 python3tutorial_flow.py run --movie_data=path/to/movies.csv --max_genres=5

· 为了在工作流中读取这些自定义输入,Metaflow提供了IncludeFile和Parameter 对象。选择用IncludeFile还是Parameter 对象分配给类变量来访问传入的参数,这具体取决于读取的是文件还是常规值。

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读取通过CLI传递的自定义参数

将Conda 注入流

· 完成上面 Conda 设置部分中概述的步骤。

· 将Metaflow 提供的@conda_base添加到流的类中。它期望传入python版本,可以硬编码,也可以像下面这样通过函数提供。

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将Conda 注入流

· 现在可以将@conda添加到流中的任何步骤。它期望通过libraries参数传递具有依赖关系的对象。Metaflow将负责在执行步骤之前准备带有这些依赖项的容器。可以在不同的步骤中使用不同版本的包,因为Metaflow 在不同的容器中运行每个步骤。

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· 新运行命令: python3tutorial_flow.py --environment=conda run

实施'start’

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实施“开始”步骤

有些事情需要注意:

· 注意到在步骤函数中pandas导入语句是如何存在的吗?这是因为它只是由 conda 仅仅注入在这个步骤的范围内。

· 然而,这里定义的变量(dataframe & genres ),甚至可以通过之后运行的步骤来访问。这是因为Metaflow 的工作原理是隔离运行环境,但是允许数据自然地流动。

实现 'compute_statistics’ 步骤

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实施 `compute_statistics` 步骤

请注意,此步骤正在访问和修改前一个start步骤中定义的dataframe变量。接下来的步骤里,这个新的修改后的dataframe将是有效的。

实施 ‘join’ 步骤

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实施`join` 步骤

需要关注的事情:

· 在这个步骤中,使用了完全不同版本的pandas库。

· 输入数组中的每个索引都表示在此之前运行的compute_statistics的副本。它包含运行的状态,即各个变量的值。因此,input[0].quartiles可以包含喜剧风格的四分位数,而input[1].quartiles可以包含科幻风格的四分位数。

最终展示:

看它的流程设计:

  1. python3 tutorial_flow.py--environment=conda show

运行:

  1. python3 tutorial_flow.py--environment=conda run --movie_data=path/to/movies.csv --max_genres=7

通过客户端API检查运行情况

可以利用Metaflow提供的客户端API来检查过去运行的数据和状态快照。它是在笔记本上探索历史运行细节的理想工具。

下面是一个简单的片段,录入了GenreStatsFlow上次成功运行的genre_stats变量。

  1. from metaflow import Flow, get_metadata
  2. # Print metadata provider
  3. print("Using metadata provider: %s"% get_metadata())
  4. # Load the analysis from the MovieStatsFlow.
  5. run = Flow('GenreStatsFlow').latest_successful_run
  6. print("Using analysis from '%s'"%str(run))
  7. genre_stats = run.data.genre_stats
  8. print(genre_stats)

metaflow_client_api_demo.py hosted with ❤ by GitHub

Metaflow客户端API演示

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云端运行

在本地系统上做了一些原型之后,如何利用云资源来加快速度?

目前,Metaflow只支持与AWS的集成,下面是AWS服务Metaflow使用的并排比较。

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Metaflow与AWS的集成

· 首先,需要在 AWS 上进行一次性设置,以便为 Metaflow 运行创建资源。如果希望共享和访问彼此的运行,您的团队可以利用相同的资源。参考本页面的指示说明。Metaflow为设置提供了一个 Cloudformation 模板,因此毫不费时。

· 然后,在本地系统上运行metaflow configure aws,并提供提示的详细信息。这一步很重要,Metaflow 因此可以使用刚刚在 AWS 上设置的数据存储和元存储。

· 现在,要在云端本地系统上运行任何工作流,只需将--with batch 添加到运行命令中。举个例子,python3 sample_flow.py run--with batch. 简直小菜一碟!

· 对于混合运行,即在本地运行几个步骤,得在云上运行几个步骤——在希望在云上运行的工作流中的步骤中添加 @batch。例如:@batch(cpu=1, memory=500)

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Metaflow的局限性与未来展望

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图源:Unsplash

· 与AWS的紧密集成,尽管路线图中有支持更多云提供商的计划。

· Metaflow 完全基于CLI,不附带GUI。(不像其他通用的工作流框架,如Airflow)

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问题与反馈

如果你有任何进一步的问题或反馈,或如果有任何新的技术分享,请在评论区留言,大家一起讨论~

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